La Laguna Bacalar es un Ecosistema lagunar-Costero de playas, pantanos, bosques inundables, ríos, lagunas, estuarios y manglares. Se encuentra ubicada en el Municipio de Juan Francisco Bulnes Departamento de Gracias a Dios, su extensión es de aproximadamente 311 has de espejo de agua, el Proyecto PROLAB ha definido como su área de influencia y que rodea la laguna, un polígono de  aproximadamente 5,300 has, entre las latitudes de 15° 55’ y 15° 59’ Norte y las longitudes de 84° 54’ y 84° 59’ Oeste; esta zona se encuentra ubicada en el limite del área de Amortiguamiento de la zona Protegida de la Biosfera del Rió Plátano; tiene su desembocadura al mar por la Barra de Palacios, siendo una ruta estratégica de entrada a la Biosfera.  Además por sus conexiones a la Laguna de Ibans, a través del Canal de Siblabla y los empalmes al Río la Criba y con el Río Tinto o negro hacen que este Ecosistema sea de una importancia como hábitat para varias especies de agua dulce y marinas.